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2025-5-6

基因工程小鼠名稱解讀

基因工程（chéng）小鼠

基因工程小鼠：也（yě）叫遺傳工程小（xiǎo）鼠，是（shì）指通過基因工程技術手段，對小鼠（shǔ）基因組（zǔ）進行一定（dìng）的人（rén）為修飾，由此產生（shēng）具有特定表型或特征的小鼠。

在本號（hào）前文“小白鼠不是全部”中，我們介紹了常用實驗小鼠品（pǐn）係的命（mìng）名規則。除了野生型實驗小鼠外，基（jī）因工程小鼠是更為常用的科研對象。在閱讀（dú）文獻（xiàn）時，我們經常會看到一長串的包含字母、數字（zì）、上標、括號等組（zǔ）成的小（xiǎo）鼠名稱，它們都代表什麽意思呢？本文就針對這一問題來解讀一下基因工程（chéng）小鼠中字母、符號和數字等的含義。

基（jī）因工程（chéng）小鼠通常可分為如下兩類：

基因定點修飾小鼠：

a. 應用胚胎幹細胞打靶技術（shù）構建的基因敲除和敲入小鼠

b. 應用CRISPR/Cas9等核酸內切酶係統構建（jiàn）的基因敲除、點突（tū）變、定點敲入小鼠

轉基因小鼠：

應用原核注射、慢病毒感染方法構建的轉基因小鼠（shǔ）

1、基因定點修飾小（xiǎo）鼠（shǔ）

首先，我們先介紹（shào）下（xià）關於基因定點修飾小鼠的名稱含義，就以下圖這個小鼠為例：

上圖（tú）顯示了基因定點修飾小（xiǎo）鼠名稱的6個組成部分，下麵依次對這（zhè）6部分的信息進行解讀。

（1）背景品係：

指（zhǐ）用於構建基（jī）因修飾小鼠模型的背（bèi）景品係。如果這個小鼠（shǔ）背（bèi）景是單一來源，就直接寫該小鼠背景的品係名稱即可，如上圖中的（de）C57BL/6J。如（rú）果（guǒ）是混合來源的話，會出（chū）現如下多種寫法，分別代表不同含義。我們就舉幾（jǐ）個例子進（jìn）行說（shuō）明。

（2）基因名稱：

我們需要（yào）區分兩種基因名稱寫法，即Gene Symbol 和（hé）Gene Name。

Gene Symbol指的是基因的簡稱，比如（rú）Prrt2；Gene Name指的是基因的全名，比如proline-rich trans membrane protein 2，如果我們要查（chá）找某個基因編輯的小鼠模型，最好輸入（rù）Gene Symbol 。

Gene Symbol 和Gene Name二者的特點如下（xià）：

Gene Symbol：

物種中唯一的

短，3-5個字母，最多不超過（guò）10個字母

隻用羅馬字母和阿拉伯數字

大寫字母開頭，後（hòu）跟小寫（xiě）字母或數字

不包括組織特（tè）異性或（huò）分子（zǐ）量

最好跟 Gene Name 的首字母一致（zhì）

斜體表示

不同物種的同源基因使用相（xiàng）同的Gene Symbol

Gene Name ：

簡短，可以是幾個單（dān）詞（cí），包（bāo）含基因功能或特點

首字母小寫（人名或專有名詞除外）

使用（yòng）美式拚寫方法

小鼠中（zhōng）還存在兩個常用的定點過表達整合位點，一個 Rosa26位點，一（yī）個是 H11位點。Rosa26是一個基因（yīn），所以可以用它的Gene Symbol，也就（jiù）是 Gt(ROSA)26Sor。H11並不是（shì）某（mǒu）一個特定基因，而（ér）是（shì）存（cún）在於（yú）兩個基因（yīn）之間的一（yī）個特定染色體位置（zhì），所以沒有Gene Symbol。目前公認的命名是 Igs2，表示 intergenic site 2 的（de）縮寫。

（3）基（jī）因修飾方式：

基因修飾方式一般分為兩種：tm和em

tm：利用ES打靶技術構建的小鼠，用 tm 表示，tm代表 targeted mutation

em：核酸內切酶係統（tǒng）（比（bǐ）如CRISPR/Cas9）介（jiè）導（dǎo）的基因修飾，用em表示 endonuclease-mediated mutation。

（4）編號：

這（zhè）裏的編號通常是指最初（chū）構建（jiàn）該模型小鼠的實驗室對其初建時的首建（Founder）小鼠的（de）序列號。例如：Trp53 tm1Holl ，表示在Holl實驗室對Trp53基因（yīn）進行突變得到的首建小鼠編號為1，並由該首建鼠繁育擴群得到的（de）基因編輯小鼠群體（tǐ）或品係。

有時候會看到 tm1.1、tm1.2的情況，這是指條件性基因敲除（CKO）小鼠在與重組酶工具小（xiǎo）鼠（Cre小鼠）交配後（hòu）獲得的子代小鼠品係，為了與親（qīn）代 CKO 小鼠（編號為 tm1）區（qū）分。

（5）插（chā）入結構：

如（rú）果有敲入的外源（yuán）基因，可以在括號（hào）內寫出插入的外源基因。

例如：Cd19 tm1(cre)Cgn，表（biǎo）示插入外源基因Cre

如果（guǒ）敲入的是（shì）RNAi，那麽把RNAi針對的靶點寫進括號中。

例如：Gene tm # (RNAi:Il23a) Labcode，表示插入RNAi，打（dǎ）靶（bǎ）II23a基（jī）因

對於基因敲除和條件性基因敲除，在名稱中一般（bān）不用加入插入結（jié）構的部分，即編號後緊跟實驗室代號（hào）。

（6）實驗室代號：

一般實驗室（shì）代號是機構名稱的縮（suō）寫（xiě）。

常見實驗室代碼：

J —— The Jackson Laboratory

Kyo —— Kyoto University

N —National Insititutes of Health

Crl ——The Charles River Laboratory

Rik ——The Institute of Physical and Chemical Research（RIKEN）

綜合上（shàng）述的講（jiǎng）解，我們再來看下前麵的那個例子：

我們可以獲得如下信（xìn）息：

因此，該小鼠名稱（chēng）包含了如下信息（xī）：Ksak實驗室以C57BL/6J小鼠為背景品係，利用胚胎幹細胞（bāo）基因打靶方法，構建（jiàn）的在Slc1a3基因位點插入Cre重組酶，首（shǒu）建鼠編號為1的小鼠及其後代。

當（dāng）然，如果你認為從一個基因工程小鼠的名稱得到的信息還不（bú）夠，並想了解有（yǒu）關該小鼠更多的信息，可以查閱相關文獻或到有關網站上搜索，比如http://www.informatics.jax.org/這個網站。

2、轉基因小鼠

轉基因小鼠是（shì）指基因組中隨機整合外源基因（yīn），並在體內表達該外源基因的小鼠。這類（lèi）小鼠也有自己特定（dìng）的命名規則，這裏（lǐ）我們也用一個例子來進行講解。

從上麵的小鼠全名，我們可以看到轉基因小鼠的命名規則有些部分（fèn）與基因定點修飾小鼠是相同的，現在我們就針對其中不一樣的部分進行解讀。

（1）轉基因縮寫：

Tg（Transgene）代表轉基因，如果是轉座子介導的轉基因，命名時需要在Tg後麵加上Tn，表示（shì）transposable element。後麵（miàn）的括號內包（bāo）括（kuò）：所使用的轉座子係統縮寫（xiě），以及構建（jiàn）的載體結構，兩者用「-」鏈接。

（2）轉入基因：

在括號中填入轉入基因的啟動子信息以及Gene Symbol。由於轉入（rù）的基因是外來DNA材（cái）料的隨機插入，且不（bú）是天然基因組的（de）一部（bù）分，所（suǒ）以不需（xū）要寫成斜體。

上麵（miàn）跟大家簡述了關於基因工程（chéng）小鼠的名稱組（zǔ）成，但（dàn）是我們在日常科研（yán）工作以及（jí）寫文章中（zhōng），如果每次都寫小鼠（shǔ）全名的話，那會比較繁瑣。通常（cháng），我們（men）也可以采用簡寫的方式對所用（yòng）的基因工程（chéng）小鼠進行表述。下表我們就對目前常（cháng）用的基因工程小鼠類型進行一下簡寫規則的說明和舉例。